2015
자동화된 약물 스크리닝 접근법은 많은양을 small molecular 자료로부터 신속하게 원하는 표현형을 식별 할 수 있게한다. 하지만, 후보 분자군은 약리학적으로 매우 다양하기 때문에 약물 기작에 대한 통찰은 매우 제한적이다.
본 논문에서는 Drug-set enrichment analysis(DSEA) 라는 방법을 소개한다. 이 방법은 약물 집합이 타겟으로 하는 pathway를 식별 가능하게 한다. DSEA는 관심 표현형과 관련없는 약물 특이적인 효과를 희석함으로 표현형 특이적인 pathway를 주목하게 하여, 약물집합의 기작에 관한 가설을 세우는데 도움을 준다.
본 논문에서는 약리학적으로 연관된 5가지의 다른 약물 집합을 분석하여 이 방법을 검증했다. 그 후, DSEA를 적용하여 낭포성 섬유화 전달체 조절자 유전자 기능을 부분적으로 회복시키는데 일부 효과가 있는 약물들 사이에서 공유되는 기작을 식별하였다.
Comment
약물의 집합에 대한 기작은 생각 못해보았음. 새로운 관점이다.
Original paper
https://academic.oup.com/bioinformatics/article/32/2/235/1743543
https://academic.oup.com/bioinformatics/article/32/2/235/1743543
academic.oup.com