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2007 다양한 프로그램은 유전자 집합내에서 Gene Ontology(GO) 범주의 유전적 풍부도 또는 부족함을 결정한다. 문제의 수식화가 exact null distribution으로 이끌지만, 이런 GO 도구들은 종종 결정의 기반이 되는 p-value 계산을 명확하게 하지 않는 다양한 통계검정을 사용한다. 본 논문에서는 문제의 다양한 수식화와 그로인해 얻어지는 검정들을 검토한다. 그 예로는 이항, 카이제곱, 동질성 검정, 초기하검정, 피셔 정확 검정등이 있다. 이 검정들간의 관계를 명확히 하며, 특히 초기하검정과 피셔 정확검정간의 동일성을 설명한다. 다른 검정들은 콘 표본에만 유효하며, 두 확률의 동질성 검정과 카이제곱 검정은 동일하다. 또한 one-tailed & two-tailed p-value의..

2015 자동화된 약물 스크리닝 접근법은 많은양을 small molecular 자료로부터 신속하게 원하는 표현형을 식별 할 수 있게한다. 하지만, 후보 분자군은 약리학적으로 매우 다양하기 때문에 약물 기작에 대한 통찰은 매우 제한적이다. 본 논문에서는 Drug-set enrichment analysis(DSEA) 라는 방법을 소개한다. 이 방법은 약물 집합이 타겟으로 하는 pathway를 식별 가능하게 한다. DSEA는 관심 표현형과 관련없는 약물 특이적인 효과를 희석함으로 표현형 특이적인 pathway를 주목하게 하여, 약물집합의 기작에 관한 가설을 세우는데 도움을 준다. 본 논문에서는 약리학적으로 연관된 5가지의 다른 약물 집합을 분석하여 이 방법을 검증했다. 그 후, DSEA를 적용하여 낭포성 섬유..