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Intro Survival analysis, 한국어로 생존분석은 관심있는 사건이 발생하는 시간을 통계적으로 분석하는 방법이다. 생존이라 이름이 붙은 이유는, 일반적으로 의료 분야에서 환자의 사망까지 걸리는 시간에 대한 분석을 하기때문으로 생각된다. (뇌피셜임!) 때문에 꼭 사망을 관심있는 사건으로 보지 않아도 된다. 가령, 환자의 예후예측뿐 아니라, 고객의 상품에 대한 이탈 분석에도 사용이 가능하다. 이 포스터에서는 관심있는 사건을 사망으로 보며, 간단히 생존분석의 개념과 비모수 방법중 Kaplan-Meier 추정에 대해 알아볼 예정이다. 이 과목이 디테일하게는 대학원 이상의 수준을 다루고있어서 정보 손실의 최소화라거나, 다른 추정 방식 및 수학적 엄밀함을 포함하는 전반적인 내용은 따로 정리할 예정이다...

반응형 그래프를 쓰고싶어요! R에서 생성한 ploty figure를 tistory에 삽입하고 싶다. Python으로 그린 plotly 삽입하는 방법을 쉽게 적용 가능하도록 설명해주신 블로그(감사합니다!)를 참고하여, R에서도 그대로 plotly object를 json으로 바꾸어 진행해보았다. Code R plotly to json plotly_json(p = last_plot(), jsonedit = interactive(), pretty = TRUE) HTML에 넣기 이게 처음 몇번의 상호작용은 가능하지만, 중간에 멈춰버린다... ㅠㅜ References https://mizykk.tistory.com/50 [plotly] 티스토리/웹페이지에 반응형 그래프 올리기 티스토리에 글을 쓰다보니 반응형 그래프..

Permutation of Regressor Residual Permutation of Regressor Residual (PRR)은 regression analysis에서 permutation test & covariate adjustment를 같이 할 수 있게하는 방법론이다. Permutation test 종종 적은 표본수의 경우와 같이 모수 기반의 통계기법을 사용하기 어려울 때가 있다. 이럴 때에는 여러 비모수 방법을 사용하는데 그중에서 많이 사용하는 방법으로 permutation test가 있다. 이 방법은 영가설 하에, 주어진 자료의 라벨을 섞음으로 모든 가능한 경우에 대한 영분포를 만든다. (여기서 중요한 부분은 검정 대상이 되는 변수의 관계성이 끊어져야, 원래의 관계성과는 상관없는 영분포가 ..

IC 50 Half maximal inhibitory concentration (IC50) 는 in vitro 에서 생물학적인 활성도를 억제(또는 촉진)하는 chemical의 효과를 나타내는 지표이다. 의미 IC50은 생물학 및 약물 연구에서 흔히 사용되는 개념 중 하나로, 어떤 물질이 생물학적 프로세스에 얼마나 강력하게 영향을 미치는지를 측정하는 데 도움이 된다. 만약 어떤 약물이나 화합물을 개발하고 있을 때, 이 약물이 특정 생물학적 프로세스를 얼마나 효과적으로 억제 또는 촉진하는지를 알고 싶을 것이다. 이때, 그 약물의 농도가 중요한 역할을 한다. IC50은 반응이 일어나는 데 필요한 약물의 농도를 나타낸다. 예를들어, 염증이 유발된 세포에 대한 어떤 화합물의 유용성을 조사하고 있을때를 생각해보자...