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WGCNA 1

Weighted Gene Co-expression Network Analysis

예전에 정리해둔 노션을 옮겨왔습니다. 중간중간 옮겨오며 오류가 나는 부분이 있을 수 있습니다. 내용이 너무 많아 한글로 다시 정리하기 힘들어 거의 그냥 가져다놓았습니다 ㅠㅠ Intro WGCNA는 유전자간의 correlation을 기반으로 유전자 군집화를 진행 할 수 있게하는 알고리즘이다. 이 방법은 상당히 직관적인 아이디어로 구성되어있으며, 필요에 따라 biweight midcorrelation과 dynamic tree cut과 같은 독자적인 방법론을 만들어 적용하였다. 개선가능해보이는 부분 또는 풀리지 않은 질문은 이렇게 하이라이트 해놓았다. 총 네 단계로 이루어져 있으며 아래와 같이 작동한다. 이제부터 정리 시작! Weighted Gene Coexpression Network Analysis (WG..

정리 조금/Bioinformatics & Biostatistics 2023.10.26
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개념 조금과 마주치는 문제상황을 기록하는 일기장같은 블로그입니다 #통계 #생물정보학 #기계학습

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Deg, rnaseq, Python, Federated Learning, virtual environment, r, F1 Score, Characteristic Direction, enrichment, Drug repurposing, PAEA, L1000, image, Split Learning, LDA, QDA, cmap, GSEA, Microarray, Gene set,

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