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Tanimoto Coefficient

Tanimoto Coefficient유사도를 측정하는 metric중 하나이다. Tanimoto coefficient (or similarity)는 화합물 사이의 유사도, 약물 유사도를 측정할때 많이 사용되는 방법이다. 사실 이 유사도는 Jaccard similarity의 continuous version으로, 그냥 Jaccard similarity로 표기하는 사람도 있다. Pearson correlation coefficient 와 point-biserial correlation coefficient 의 관계와 비슷하다. 두 집합의 교집합 크기를, 두 집합의 합집합 크기로 나눈 값으로 정의되며, 식은 아래와 같다.$$\frac{|A \cap B|}{|A \cup B|}$$직관적으로 A와 B사이에 얼마나 ..

정리 조금/Basics 2024.05.02
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개념 조금과 마주치는 문제상황을 기록하는 일기장같은 블로그입니다 #통계 #생물정보학 #기계학습

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F1 Score, Characteristic Direction, cmap, L1000, Gene set, virtual environment, image, QDA, Deg, enrichment, LDA, r, Python, Drug repurposing, Split Learning, PAEA, GSEA, Microarray, Federated Learning, rnaseq,

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